A BepiColombo a legutóbbi elrepülése során nem került olyan közel a Merkúrhoz, mint korábban, amikor 165 kilométerre közelítette meg a bolygót. Az elrepülés során sikerült bevetni a Mercury Radiometer és Thermal Infrared Spectrometer (MERTIS) elnevezésű műszert, mely méri a bolygó felszínének hőmérsékletét és összetételét, és feltárja, hogy milyen típusú ásványok találhatók a bolygó felszínén.
Az eredeti küldetési terv szerint az űrszonda 2025 decemberében állt volna pályára a Merkúr körül, de a tolómotor-hibák miatt kissé lelassult a szonda, így csak 2026 novemberében állhat majd pályára. Ekkor az űrszonda ketté fog válni, hogy az ESA Mercury Planetary Orbitere és a JAXA Mercury Magnetospheric Orbitere két külön pályán keringjen tovább és műszereikkel további megfigyeléseket végezzenek.