Még 2002-ben került elő az a koponya, melyről egyre több kutató véli azt, hogy Mátyás király maradványa lehet, miután a lelet nagy hasonlóságot mutat Corvin János feltárt koponyájával. A László Gyula Kutatóközpont kutatócsoportja kezdetben azt feltételezte, hogy a koponya az 1298 és 1308 között uralkodó osztrák herceg és német király Habsburg Alberté volt.
A kutatók most fejlett DNS-elemzést alkalmaznak, hogy megbizonyosodjanak arról, a maradványok tényleg Mátyás királyhoz tartoznak. Martin Trautmann neves igazságügyi antropológus szakvéleménye szintén megerősíti ezt a feltételezést. Gábor Emese kutató pedig egy 3D-s rekonstrukciót is készített a koponyához, melyről egy YouTube-videóban hosszasan mesél.