Sokan látják a szén-dioxid-kibocsátás csökkentésének megoldását a hidrogén-üzemanyagban, ám tudósok szerint ha a levegőbe jut ez a "zöld" üzemanyag, hasonló károkat okozhat az éghajlatunk változásában, mint a jelenleg legtöbbet használt szén.
Az Environmental Defense Fund non-profit csoport klímakutatója arra figyelmezteti az embereket, hogy a zöldnek gondolt hidrogén ugyanolyan, sőt akár még károsabb lehet a klímaváltozás szempontjából, ugyanis a hidrogén a levegőbe jutás esetén kémiai reakciók sorozatát indítja el, amelyek felmelegítik a levegőt, és közvetett üvegházhatású gázként működnek. Bár a hidrogén gyorsabban távozik a légkörből, mint a szén-dioxid, de rövid távon így is óriási gondokat okozhat.
Ilissa Ocko klímakutató szerint nem szabad megijedni a problémáktól, inkább azt kell kidolgozni, hogy minél jobban szigetelve legyenek a hidrogén szállítás során a csövek, hogy ne kerüljön a levegőbe semmi. Világszerte a kormányok egyre nagyobb pénzeket ölnek a hidrogén felhasználásába, éppen ezért fontos, hogy még most kell úgy kialakítani mindent, hogy az biztonságos és környezetkímélő legyen.
